Szkoła Podstawowa nr 16 im. Szczecińskich Olimpijczyków w Szczecinie jest jednostką organizacyjną Miasta Szczecina, prowadzoną w formie jednostki budżetowej. Szkoła działa na podstawie ustawy z dnia 7 września 1991 r. o systemie oświaty (Dz. U. z 2004 r. Nr 256, poz. 2572 z późn. zm.).
Organem prowadzącym Szkołę jest Miasto Szczecin
Organem prowadzącym nadzór pedagogiczny nad Szkołą jest Zachodniopomorski Kurator Oświaty w Szczecinie.